Могут ли выселить из квартиры если в ней двое малолетних ( 8 и 5 лет ) детей? Хозяином квартиры является отец ( должник)

Да, могут.
Выселение из квартиры, независимо от того живут ли в квартире дети, происходит по требованию собственника квартиры на основании или решения суда или судебного исполнителя в рамках исполнительного производства.